Кафедра економічної теорії існує з часу відродження Києво-Могилянської академії 1992 року і забезпечує підготовку фахівців зі спеціальності “Економічна теорія”. Перший випуск відбувся 1996 року. Спеціальність “Економічна теорія” в НаУКМА була акредитована ДАК України за IV рівнем в 1998 році, а в 2008 році успішно пройшла повторну акредитацію за цим рівнем. Навчальний процес відповідає державним стандартам і затвердженій освітньо-кваліфікаційній характеристиці спеціальності для фахівця, здатного виконувати професійну роботу на первинних посадах економіста, економічного радника, консультанта з економічних питань, оглядача з економічних питань, наукового працівника (економіка).
Особливістю програм кафедри є орієнтація на англо-американську модель університетської освіти, що передбачає поглиблене опанування студентами сучасних теоретичних знань, на базі яких формуються практичні вміння творчо здійснювати аналітичну роботу широкого профілю, а також готує випускників до подальшого навчання та ефективного застосування нових знань на практиці. Аналітичний досвід формується у студентів завдяки поєднанню навчання та дослідницької діяльності.
Викладачі кафедри розробляють такі актуальні наукові напрями: перехідна економіка та економічні реформи, економічне зростання, структурна політика й економічна теорія технологічних змін, проблеми міжнародної торгівлі та торгівельної політики, європейська економічна інтеграція, стратегія і тактика підвищення цінності фірми, економіка транспорту, проблеми вищої освіти в Україні.